RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SV2AQ7L0J3 742 aa7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.25□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CLDN3O15551 220 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATP9AO75110 1047 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 NUDT17P0C025 328 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM163BP0C2L3 166 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TNNI1P19237 187 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMOD1P28289 359 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 GGCXP38435 758 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 GCLMP48507 274 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 RELL1Q8IUW5 271 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC89Q8N998 374 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATL2Q8NHH9 583 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HELQQ8TDG4 1101 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AFG1LQ8WV93 481 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PGM2Q96G03 612 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FMO2Q99518 471 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CGRRF1Q99675 332 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ASB7Q9H672 318 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PARVAQ9NVD7 372 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCN4AP35499 1836 aa7.23□□□□□ -1.25
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