RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF480Q8WV37 535 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 ST8SIA2Q92186 375 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 MNTQ99583 582 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.11□□□□□ -1.59
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CLVS1-209ENST00000522928 TEKT5Q96M29 485 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-209ENST00000522928 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.1□□□□□ -1.59
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CLVS1-209ENST00000522928 MB21D1Q8N884 522 aa5.09□□□□□ -1.59
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CLVS1-209ENST00000522928 PTPN21Q16825 1174 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.08□□□□□ -1.6
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CLVS1-209ENST00000522928 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 NRN1LQ496H8 165 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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CLVS1-209ENST00000522928 COA7Q96BR5 231 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 MYOCQ99972 504 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 TEX101Q9BY14 249 aa5.07□□□□□ -1.6
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