RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522180.5

TBC1D9B-215, Transcript of TBC1 domain family member 9B, human

TSL 4

Gene TBC1D9B, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D9B-215	ENST00000522180	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	XYLB	O75191	536 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	TH	P07101	528 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	POU2F2	P09086	479 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D9B-215	ENST00000522180	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PFKFB2	O60825	505 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CD72	P21854	359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	FGFR3	P22607	806 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	OR1D2	P34982	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	TXK	P42681	527 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PFKP	Q01813	784 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CALCRL	Q16602	461 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	NELL1	Q92832	810 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	KRT2	P35908	639 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	MAGEA9	P43362	315 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	FZD5	Q13467	585 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	POTEH	Q6S545	545 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	NELL2	Q99435	816 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	FRYL	O94915	3013 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	ACKR2	O00590	384 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	WNT7A	O00755	349 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	N4BP3	O15049	544 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	SPTLC1	O15269	473 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	ECI2	O75521	394 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	RECQL4	O94761	1208 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	WASF1	Q92558	559 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	COL4A3	Q01955	1670 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	LILRB5	O75023	590 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	B3GAT3	O94766	335 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	EDN1	P05305	212 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	MAPK6	Q16659	721 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D9B-215	ENST00000522180	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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