RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516252.1

RNU6-415P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 415, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-415P, Length 97 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-415P-201ENST00000516252 GPR3P46089 330 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 LCORLQ8N3X6 602 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 K7ESF4 209 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF185O15231 689 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 ATP5JP18859 108 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 MTNR1BP49286 362 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 CHN2P52757 468 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 PTTG1IPP53801 180 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 MGAT2Q10469 447 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 NOMO1Q15155 1222 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 AFMIDQ63HM1 303 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 MRI1Q9BV20 369 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 GRID2IPA4D2P6 1211 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 LPXNO60711 386 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 POMCP01189 267 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 RAP2AP10114 183 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 GUCY1A2P33402 732 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 RAP2BP61225 183 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 COQ10AQ96MF6 247 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 PPP3CAQ08209 521 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 ATP2B3Q16720 1220 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 MED25Q71SY5 747 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 RNF181Q9P0P0 153 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 DKK2Q9UBU2 259 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 COL4A3Q01955 1670 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 CFIP05156 583 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 HKR1P10072 659 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 OSMP13725 252 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 BMP5P22003 454 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 ERVK-21P61565 698 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 Q6YL49 198 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 CAVIN3Q969G5 261 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-415P-201ENST00000516252 MARCH11A6NNE9 402 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 CDKL5O76039 1030 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 ALAS1P13196 640 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 TGM1P22735 817 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 PROZP22891 400 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 COL10A1Q03692 680 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 RESTQ13127 1097 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 METRNLQ641Q3 311 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 COG1Q8WTW3 980 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 TEX101Q9BY14 249 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 SPC25Q9HBM1 224 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 DNM3Q9UQ16 869 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 PIPSLA2A3N6 862 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 GPR32O75388 356 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 AGXTP21549 392 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-415P-201ENST00000516252 ALDH1A3P47895 512 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms