RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	STRA6	Q9BX79	667 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	VEZT	Q9HBM0	779 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SUFU	Q9UMX1	484 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SNX24	Q9Y343	169 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ALG6	Q9Y672	507 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PFAS	O15067	1338 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF536	O15090	1300 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CARNS1	A5YM72	827 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM86B1	E9PN63	330 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	EML1	O00423	815 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PODXL	O00592	558 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PMM2	O15305	246 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MSH4	O15457	936 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RIPK2	O43353	540 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MARCH6	O60337	910 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	UFL1	O94874	794 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GJB6	O95452	261 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP1A2	P05177	515 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RARA	P10276	462 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RARG	P13631	454 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CCNG1	P51959	295 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PLTP	P55058	493 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNQ4	P56696	695 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PPARD	Q03181	441 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MYBPC2	Q14324	1141 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC29A2	Q14542	456 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLMAP	Q14BN4	828 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP2R5A	Q15172	486 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CBWD6	Q4V339	395 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR16	Q569H4	304 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	KCTD1	Q719H9	257 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TNS4	Q8IZW8	715 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MORC4	Q8TE76	937 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	C18orf8	Q96DM3	657 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	UIMC1	Q96RL1	719 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AGPAT1	Q99943	283 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	THAP2	Q9H0W7	228 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PARP2	Q9UGN5	583 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GGA1	Q9UJY5	639 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	UST	Q9Y2C2	406 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		5.34	□□□□□ -1.55

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