RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-210ENST00000512194 VCANP13611 3396 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 EYSQ5T1H1 3165 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TMEM82A0PJX8 343 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 NMT2O60551 498 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 COBLO75128 1261 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PLS3P13797 630 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 IFNAR1P17181 557 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 LTBRP36941 435 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 NOVP48745 357 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 USP14P54578 494 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TROAPQ12815 778 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 KCNAB2Q13303 367 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SEPT2Q15019 361 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ASPRV1Q53RT3 343 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SHISA4Q96DD7 197 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TEPSINQ96N21 525 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 WRNIP1Q96S55 665 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PTPN18Q99952 460 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GPR27Q9NS67 375 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CLEC1BQ9P126 229 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 NID2Q14112 1375 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DEXIO95424 95 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 LARGE1O95461 756 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 RXRAP19793 462 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SMARCA1P28370 1054 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TRAF1Q13077 416 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GRM4Q14833 912 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CCDC96Q2M329 555 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SLFN13Q68D06 897 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DIO2Q92813 273 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 WNK4Q96J92 1243 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 MYL10Q9BUA6 226 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DNAJC18Q9H819 358 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 MYH1P12882 1939 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 STK36Q9NRP7 1315 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 KLRF2D3W0D1 207 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 F5H6K3 240 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 STX6O43752 255 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PRNPP04156 253 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SLC1A4P43007 532 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 KLRC3Q07444 240 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 IKZF1Q13422 519 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 BRAPQ7Z569 592 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 NAT16Q8N8M0 369 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 LPAR1Q92633 364 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DDX11Q96FC9 970 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ERO1AQ96HE7 468 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 C8orf76Q96K31 380 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 TMX2Q9Y320 296 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 FOCADQ5VW36 1801 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 A0A087X0B3 334 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 C19orf81C9J6K1 198 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ARNTLO00327 626 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ASLP04424 464 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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