RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 E2F4Q16254 413 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 FUT10Q6P4F1 479 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX12PQ92771 950 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 STAMQ92783 540 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 BICD1Q96G01 975 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 IRAK3Q9Y616 596 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CARNS1A5YM72 827 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TOM1L1O75674 476 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 THP07101 528 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 ZP2Q05996 745 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNN1Q92952 543 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TCHPQ9BT92 498 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TBX20Q9UMR3 447 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM189A1O60320 539 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 LILRB3O75022 631 aa20.47■□□□□ 0.87
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SH3BP2-218ENST00000511185 TNFSF9P41273 254 aa20.47■□□□□ 0.87
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SH3BP2-218ENST00000511185 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 KANK3Q6NY19 840 aa20.47■□□□□ 0.87
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZPBP2Q6X784 338 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SCN1AP35498 2009 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CUTAO60888 179 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCNKBP51801 687 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP5P51878 434 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 MCL1Q07820 350 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 XKR4Q5GH76 650 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 RTP2Q5QGT7 225 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SV2BQ7L1I2 683 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 DHX58Q96C10 678 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.46■□□□□ 0.87
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SH3BP2-218ENST00000511185 FSD2A1L4K1 749 aa20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R37O75864 691 aa20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-218ENST00000511185 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-218ENST00000511185 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 S1PR5Q9H228 398 aa20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-218ENST00000511185 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIOO75962 3097 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.44■□□□□ 0.86
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SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN3O15551 220 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 NR1I2O75469 434 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 WEE2P0C1S8 567 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.44■□□□□ 0.86
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SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 SUSD6Q92537 303 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP10Q92851 521 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ACAP3Q96P50 834 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 CHST7Q9NS84 486 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 I3L4J1 428 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 MYBP10242 640 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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