RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 MYOM2P54296 1465 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 NOS1P29475 1434 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 PTPRUQ92729 1446 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 ERBINQ96RT1 1412 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 MFAP3LO75121 409 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 ALDH1A2O94788 518 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 LSP1P33241 339 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 OCRLQ01968 901 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 RABL3Q5HYI8 236 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 METTL24Q5JXM2 366 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 GAB3Q8WWW8 586 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 ST8SIA2Q92186 375 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 GLI3P10071 1580 aa6.52□□□□□ -1.36
PDE4D-217ENST00000509355 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 ENPP3O14638 875 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 FKBP9O95302 570 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 NR4A1P22736 598 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 EMC7Q9NPA0 242 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 NCDNQ9UBB6 729 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 SLIT2O94813 1529 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 NRP1O14786 923 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 RPS6KA4O75676 772 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 BPIP17213 487 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 MRGPREQ86SM8 312 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 LENG9Q96B70 501 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 ARL8AQ96BM9 186 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 PRSS50Q9UI38 385 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 DISP2A7MBM2 1401 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 BROXQ5VW32 411 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 FERMT2Q96AC1 680 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 PRRX2Q99811 253 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 USP18Q9UMW8 372 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 RAMP2O60895 175 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 GNAT2P19087 354 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 CASRP41180 1078 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 PTTG1IPP53801 180 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 WNT3AP56704 352 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 RASSF3Q86WH2 238 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 MB21D1Q8N884 522 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 ZG16BQ96DA0 208 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 PGBD4Q96DM1 585 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 METP08581 1390 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 NRP2O60462 931 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 FAM20BO75063 409 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 COL10A1Q03692 680 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 PDCD1Q15116 288 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 UBE3CQ15386 1083 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 CSRP2Q16527 193 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 GPR162Q16538 588 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 DOK3Q7L591 496 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF276Q8N554 614 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 HAS1Q92839 578 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 SLC5A5Q92911 643 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 AGAP2Q99490 1192 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 TTPALQ9BTX7 342 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 ANO3Q9BYT9 981 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 FZD1Q9UP38 647 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-217ENST00000509355 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.48□□□□□ -1.37
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