RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 HPS3Q969F9 1004 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 TMX3Q96JJ7 454 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 LRGUKQ96M69 825 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 NCANO14594 1321 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 AP1G1O43747 822 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF20P17024 532 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 HSPA6P17066 643 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 HK1P19367 917 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CLRN1P58418 232 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 RAB39AQ14964 217 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 BMT2Q1RMZ1 405 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PGS1Q32NB8 556 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 METTL24Q5JXM2 366 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 NXNQ6DKJ4 435 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 IFI44Q8TCB0 444 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 TFAP2CQ92754 450 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MVB12AQ96EY5 273 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MAP3K14Q99558 947 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MRI1Q9BV20 369 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 SPON1Q9HCB6 807 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PRRG2O14669 202 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MUSKO15146 869 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 ATP5JP18859 108 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 SCNN1GP51170 649 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 RABGGTBP53611 331 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CTXN1P60606 82 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 ADAM17P78536 824 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 VPS72Q15906 364 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CSRP2Q16527 193 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 SPATS1Q496A3 300 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 Q6ZRM9 215 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 ZFP28Q8NHY6 868 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 GPR87Q9BY21 358 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MAN2A2P49641 1150 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 RAP2BP61225 183 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CRHR2Q13324 411 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MLC1Q15049 377 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 HTR3DQ70Z44 454 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PALM2Q8IXS6 379 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 RNF169Q8NCN4 708 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PGBD4Q96DM1 585 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MNTQ99583 582 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 MYOCQ99972 504 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 POGKQ9P215 609 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 ACRV1P26436 265 aa5.71□□□□□ -1.5
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