RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 ITGB5P18084 799 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CXCL12P48061 93 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SLC11A1P49279 550 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 NTHL1P78549 312 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PFKPQ01813 784 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 LILRA6Q6PI73 481 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TMX3Q96JJ7 454 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 AIFM3Q96NN9 605 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CDH7Q9ULB5 785 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CACNA1EQ15878 2313 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0U1RQF3 1178 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CPLX1O14810 134 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA31D3P0C874 917 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 FSHRP23945 695 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 HOXA6P31267 233 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 UBE2SQ16763 222 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 KBTBD6Q86V97 674 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ABI1Q8IZP0 508 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 FGF13Q92913 245 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 GPRASP2Q96D09 838 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 OSMRQ99650 979 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 KXD1Q9BQD3 176 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 BARHL2Q9NY43 387 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 GINS2Q9Y248 185 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ACACAQ13085 2346 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PTPN13Q12923 2485 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PIK3CDO00329 1044 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 DEXIO95424 95 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 C1RP00736 705 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 KLRC1P26715 233 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MTMR1Q13613 665 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 NPY5RQ15761 445 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 KIZQ2M2Z5 673 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ODR4Q5SWX8 454 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MTSS1LQ765P7 747 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ITFG1Q8TB96 612 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SNX21Q969T3 373 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CRELD1Q96HD1 420 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CDHR1Q96JP9 859 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ESYT2A0FGR8 921 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CDKL5O76039 1030 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 DDHD2O94830 711 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 GLUD1P00367 558 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MPLP40238 635 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MCM2P49736 904 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 NAPAP54920 295 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SCAPQ12770 1279 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CUL4AQ13619 759 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PPP2R5DQ14738 602 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms