RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 HAS3O00219 553 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF263O14978 683 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 PROZP22891 400 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 PRKCIP41743 596 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ARHGAP25P42331 645 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 GJA9P57773 515 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CLDN10P78369 228 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 TRIM32Q13049 653 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ZACNQ401N2 412 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 RAET1EQ8TD07 263 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CPB2Q96IY4 423 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 WDR24Q96S15 920 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 A0A087X0T9 212 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 MYADML2A6NDP7 307 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 TREHO43280 583 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 FAM228BP0C875 321 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 VEGFBP49765 207 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 AP3M2P53677 418 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 WNT7BP56706 349 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CEP120Q8N960 986 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 FAM84AQ96KN4 292 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CDT1Q9H211 546 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 SRRDQ9UH36 339 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 PTPRJQ12913 1337 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ABLIM1O14639 778 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 FAM189A1O60320 539 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 HLA-DRAP01903 254 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 AMHR2Q16671 573 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 WDR49Q8IV35 697 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 FAM81BQ96LP2 452 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 OSMRQ99650 979 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 GPR88Q9GZN0 384 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CTAGE9A4FU28 777 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 RCCD1A6NED2 376 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 TSPAN1O60635 241 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 MCF2P10911 925 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 TNFAIP3P21580 790 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 FGFR4P22455 802 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ANXA13P27216 316 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 HTRA3P83110 453 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CAP1Q01518 475 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 SLC35F6Q8N357 371 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 KAT5Q92993 513 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 TATDN2Q93075 761 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-202ENST00000493536 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms