RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490308.1

EPB41-212, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1, humanhuman

TSL 3

Gene EPB41, Length 354 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41-212ENST00000490308 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 KCTD10Q9H3F6 313 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CD248Q9HCU0 757 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PDRG1Q9NUG6 133 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 TDP1Q9NUW8 608 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 SERPINB13Q9UIV8 391 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CA14Q9ULX7 337 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 MAFFQ9ULX9 164 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ASB1Q9Y576 335 aa3.06□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 USP19O94966 1318 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CLSPNQ9HAW4 1339 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 HMX3A6NHT5 357 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 WDR46O15213 610 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 TMEM127O75204 238 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 TADA3O75528 432 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 GSTM1P09488 218 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 THEGLP0DJG4 465 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CKMT1AP12532 417 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 GYS1P13807 737 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ARFIP2P53365 341 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 LGALS4P56470 323 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 FOXO4P98177 505 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CDC42EP1Q00587 391 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 UBXN1Q04323 297 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ADCY2Q08462 1091 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CYP4F3Q08477 520 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 MGAT2Q10469 447 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 EPS8Q12929 822 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 BFSP1Q12934 665 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 SNAPC2Q13487 334 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 SLC12A1Q13621 1099 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ACVR2BQ13705 512 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ERV3-1Q14264 604 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 DLGAP5Q15398 846 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PTPN14Q15678 1187 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 RAB30Q15771 203 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 BAK1Q16611 211 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 TIGD6Q17RP2 521 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 C5orf22Q49AR2 442 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 TCP11X2Q5H9J9 407 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 SFRP5Q5T4F7 317 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CIAPIN1Q6FI81 312 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 BORAQ6PGQ7 559 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CEP68Q76N32 757 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 RSPH3Q86UC2 560 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 TTC30AQ86WT1 665 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 HEATR4Q86WZ0 1026 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CREG2Q8IUH2 290 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 YAF2Q8IY57 180 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 CDYL2Q8N8U2 506 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 LINC00116Q8NCU8 138 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 FLCNQ8NFG4 579 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 WDR48Q8TAF3 677 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ZNF384Q8TF68 577 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 NUDT8Q8WV74 236 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ST8SIA4Q92187 359 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PTCHD1Q96NR3 888 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 KCNC2Q96PR1 638 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 YME1L1Q96TA2 773 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 HIST1H2AJQ99878 128 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 GHITMQ9H3K2 345 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms