RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 EPC1Q9H2F5 836 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MSL2Q9HCI7 577 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TDP1Q9NUW8 608 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR32O75388 356 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RAD17O75943 681 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MYBP10242 640 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ALDH1A3P47895 512 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC42EP1Q00587 391 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 NFIXQ14938 502 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PGS1Q32NB8 556 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKS6Q68DC2 871 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RSPH3Q86UC2 560 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 XYLT1Q86Y38 959 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 DRC7Q8IY82 874 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC8Q8TAM2 541 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TMX3Q96JJ7 454 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TAAR9Q96RI9 348 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K14Q99558 947 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNH6Q9H252 994 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM140Q9NV12 185 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCC2Q92887 1545 aa4.21□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 VSTM5A8MXK1 200 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SGTAO43765 313 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGB3P05106 788 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 RAP2AP10114 183 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 IL2RBP14784 551 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 DDCP20711 480 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 FLT3LGP49771 235 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP8B2P98198 1209 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.21□□□□□ -1.741e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-211ENST00000489450 SP140Q13342 867 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 MTM1Q13496 603 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ICAM4Q14773 271 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
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RABGGTB-211ENST00000489450 POLNQ7Z5Q5 900 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 D2HGDHQ8N465 521 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 IFI44Q8TCB0 444 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 RUNDC1Q96C34 613 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 DMRTA2Q96SC8 542 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CUL7Q14999 1698 aa4.2□□□□□ -1.74
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RABGGTB-211ENST00000489450 MAP2K6P52564 334 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM47AQ5JRC9 791 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC7BQ86TV6 843 aa4.2□□□□□ -1.74
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RABGGTB-211ENST00000489450 MB21D1Q8N884 522 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 Q8TCH9 128 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 RGMAQ96B86 450 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 BORCS6Q96GS4 357 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 LOXL4Q96JB6 756 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 C8orf48Q96LL4 319 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMD11Q96NU1 681 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 MYOCQ99972 504 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
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