RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474945.1

SPCS1-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPCS1, Length 981 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-204ENST00000474945 USP41Q3LFD5 358 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ARSHQ5FYA8 562 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 EPSTI1Q96J88 318 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 USP28Q96RU2 1077 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 PARVGQ9HBI0 331 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 TOM1L1O75674 476 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 GLUD1P00367 558 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 PROZP22891 400 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 NCKAP1LP55160 1127 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 CREMQ03060 361 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 USP49Q70CQ1 688 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 RNF135Q8IUD6 432 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 MYCT1Q8N699 235 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 SNX27Q96L92 541 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 CLIC6Q96NY7 704 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 POMKQ9H5K3 350 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ABLIM1O14639 778 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 LILRB3O75022 631 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 EFEMP2O95967 443 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 MYBP10242 640 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 MTHFRP42898 656 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 LIG4P49917 911 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 STK38Q15208 465 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 NAB2Q15742 525 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 RTP2Q5QGT7 225 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 KANK3Q6NY19 840 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ZPBP2Q6X784 338 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 CEP57Q86XR8 500 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ACAP3Q96P50 834 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 STK17AQ9UEE5 414 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 NR2E1Q9Y466 385 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 MYH11P35749 1972 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 B3GAT3O94766 335 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 BRD1O95696 1058 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 COL9A1P20849 921 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 CLCNKBP51801 687 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ZNF131P52739 623 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 SEZ6Q53EL9 994 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 UROC1Q96N76 676 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 TTPALQ9BTX7 342 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 CHST7Q9NS84 486 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-204ENST00000474945 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 CLDN3O15551 220 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 TRAK2O60296 914 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 STAT6P42226 847 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 MCL1Q07820 350 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 SLC39A14Q15043 492 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 PSMD5Q16401 504 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 PALB2Q86YC2 1186 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 CNTN3Q9P232 1028 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 DPP7Q9UHL4 492 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 TBX20Q9UMR3 447 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 PLXNA3P51805 1871 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-204ENST00000474945 PODXLO00592 558 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms