RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	CFAP45	Q9UL16	551 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	NCOR1	O75376	2440 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	CLDN3	O15551	220 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	EFEMP2	O95967	443 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	UROD	P06132	367 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	COASY	Q13057	564 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	FUT10	Q6P4F1	479 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	STAM	Q92783	540 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNN1	Q92952	543 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	B3GALT6	Q96L58	329 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	APOL5	Q9BWW9	433 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	MUC3A	Q02505	3323 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	TADA2A	O75478	443 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF4A	O95239	1232 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	MCL1	Q07820	350 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	DHX58	Q96C10	678 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SNX27	Q96L92	541 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	LILRB3	O75022	631 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	IDE	P14735	1019 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	GLUD2	P49448	558 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	GTF2B	Q00403	316 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	CASP10	Q92851	521 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	EPCAM	P16422	314 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SCP2	P22307	547 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	BECN1	Q14457	450 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	E2F4	Q16254	413 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	XKR4	Q5GH76	650 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	CD320	Q9NPF0	282 aa		32.01	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	PIGR	P01833	764 aa		32	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		32	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		32	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		32	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		32	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		32	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	TCHH	Q07283	1943 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	GAP43	P17677	238 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	KLRC2	P26717	231 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	CLCNKB	P51801	687 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	DSG1	Q02413	1049 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	CHST7	Q9NS84	486 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	31.99	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	PLXNA3	P51805	1871 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	CXCL8	P10145	99 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	TNFSF9	P41273	254 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	USP41	Q3LFD5	358 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	PANK4	Q9NVE7	773 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	CNTN3	Q9P232	1028 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	TISP43	B9A030	160 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNE1	P15382	129 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	ABCD1	P33897	745 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	IQUB	Q8NA54	791 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	S1PR5	Q9H228	398 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	TNMD	Q9H2S6	317 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	TEX28	O15482	410 aa		31.96	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	CLTA	P09496	248 aa		31.96	■■■□□ 2.71
FBXO18-208	ENST00000470089	ZP2	Q05996	745 aa		31.96	■■■□□ 2.71

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