RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469334.5

SMARCE1-207, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 2,128 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-207ENST00000469334 BORAQ6PGQ7 559 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.6□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 TMEM110Q86TL2 294 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 CCDC25Q86WR0 208 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 PDSS2Q86YH6 399 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.6□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 KCNN1Q92952 543 aa9.6□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.6□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 SATL1Q86VE3 508 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 RELL1Q8IUW5 271 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 BBS5Q8N3I7 341 aa9.59□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 INIPQ9NRY2 104 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.59□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 LRP5O75197 1615 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 MYMKA6NI61 221 aa9.59□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 VILLO15195 856 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 RASA4O43374 803 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 THAP12O43422 761 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 PDE5AO76074 875 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 RARBP10826 455 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 MAN1A1P33908 653 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 PGM1P36871 562 aa9.59□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 TCEAL1Q15170 157 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 Q6ZNX1 250 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 ILDR2Q71H61 639 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.59□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 TDRPQ86YL5 185 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 USP29Q9HBJ7 922 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SMARCE1-207ENST00000469334 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.59□□□□□ -0.87
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SMARCE1-207ENST00000469334 GALK1P51570 392 aa9.58□□□□□ -0.88
SMARCE1-207ENST00000469334 JAM2P57087 298 aa9.58□□□□□ -0.88
SMARCE1-207ENST00000469334 ADCY1Q08828 1119 aa9.58□□□□□ -0.88
SMARCE1-207ENST00000469334 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.58□□□□□ -0.88
SMARCE1-207ENST00000469334 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.58□□□□□ -0.88
SMARCE1-207ENST00000469334 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.58□□□□□ -0.88
SMARCE1-207ENST00000469334 TTC27Q6P3X3 843 aa9.58□□□□□ -0.88
SMARCE1-207ENST00000469334 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.58□□□□□ -0.88
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