RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 RXRBP28702 533 aa21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 MAPK4P31152 587 aa21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PASKQ96RG2 1323 aa21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PAEPP09466 180 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R7Q15435 360 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 QPCTQ16769 361 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 JDP2Q8WYK2 163 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 KAT2BQ92831 832 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 DGAT1O75907 488 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ECEL1O95672 775 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PSAPP07602 524 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PLVAPQ9BX97 442 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 AZI2Q9H6S1 392 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 KCNA2P16389 499 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 FNTAP49354 379 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 GCNT1Q02742 428 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CCDC25Q86WR0 208 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PGM2Q96G03 612 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 IFT74Q96LB3 600 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 TRIM7Q9C029 511 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 STBD1O95210 358 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 GARTP22102 1010 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SCP2P22307 547 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PRKCEQ02156 737 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SNX1Q13596 522 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SGO2Q562F6 1265 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 MAFGO15525 162 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.1
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IMP4-208ENST00000460766 FDX1P10109 184 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SLCO1A2P46721 670 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CALCOCO2Q13137 446 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SLMAPQ14BN4 828 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 FBXW10Q5XX13 1052 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 C3orf20Q8ND61 904 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ART4Q93070 314 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 GINM1Q9NU53 330 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 GGA2Q9UJY4 613 aa21.89■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 H0YHG0 523 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 TNNI1P19237 187 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 LIG4P49917 911 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 C2CD6Q53TS8 623 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ZNF516Q92618 1163 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 FNBP1Q96RU3 617 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 LRRC19Q9H756 370 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 RIPK2O43353 540 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 BACE1P56817 501 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 MTERF2Q49AM1 385 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CPLX4Q7Z7G2 160 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 RARGP13631 454 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 RRM1P23921 792 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ACTR2P61160 394 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 KRT17Q04695 432 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ADCY2Q08462 1091 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 WDR44Q5JSH3 913 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CABS1Q96KC9 395 aa21.88■■□□□ 1.09
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