RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 CD72P21854 359 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TKTP29401 623 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 MCM7P33993 719 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 OR1D2P34982 312 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 ARPP19P56211 112 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 STARD6P59095 220 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 GUCY1B3Q02153 619 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CREMQ03060 361 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 POU5F1BQ06416 359 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TUSC3Q13454 348 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TRIM29Q14134 588 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 MAPK6Q16659 721 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 SLC44A4Q53GD3 710 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 GLRA4Q5JXX5 417 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 EEF1DP3Q658K8 133 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TSSK4Q6SA08 328 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 MTSS1LQ765P7 747 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 ERMP1Q7Z2K6 904 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 C1orf210Q8IVY1 113 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 GPR65Q8IYL9 337 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 DEPTORQ8TB45 409 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PIK3R5Q8WYR1 880 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 BSNDQ8WZ55 320 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 WASF1Q92558 559 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 FGF13Q92913 245 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TNFRSF25Q93038 417 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 MCRS1Q96EZ8 462 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 SHDQ96IW2 340 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 MTMR9Q96QG7 549 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 HSD17B14Q9BPX1 270 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 KXD1Q9BQD3 176 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 ADPGKQ9BRR6 497 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TTPALQ9BTX7 342 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 KIFC3Q9BVG8 833 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 BCO2Q9BYV7 579 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 C2orf40Q9H1Z8 148 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM60Q9H2L4 133 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 FZD8Q9H461 694 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 NCDNQ9UBB6 729 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 FBXW11Q9UKB1 542 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CDH7Q9ULB5 785 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CDY1Q9Y6F8 540 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CITO14578 2027 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa3□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 KANSL1LA0AUZ9 987 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CCDC169A6NNP5 214 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 ACKR2O00590 384 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PRRG1O14668 218 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PAPLNO95428 1278 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 C1RP00736 705 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 LRG1P02750 347 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 RHOP08100 348 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 OR52Z1P0C646 297 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 HARSP12081 509 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 FDPSP14324 419 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CEBPBP17676 345 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CYP11B2P19099 503 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 FGFR3P22607 806 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 TARSP26639 723 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 HOXA9P31269 272 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 ELF1P32519 619 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 BRCC3P46736 316 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 CLCNKBP51801 687 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 OSTNP61366 133 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD109B-201ENST00000458961 PFKPQ01813 784 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms