RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WASH4PA8MWX3 477 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BS24 57 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP17A1P05093 508 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD40P25942 277 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MMP14P50281 582 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HUNKP57058 714 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSTO1P78417 241 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K12Q12852 859 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACAP2Q15057 778 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP4F22Q6NT55 531 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPACA3Q8IXA5 215 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2FQ969M7 185 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEPSINQ96N21 525 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACAP3Q96P50 834 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRIQ9BWK5 157 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZMAT4Q9H898 229 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DOCK2Q92608 1830 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM170BA6NMN3 283 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KDM1AO60341 852 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NEK3P51956 506 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE1AP54750 535 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FIGNQ5HY92 759 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEX11Q8IYF3 940 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 X6R8D5 127 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMX2A2RU54 273 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAN2B1O00754 1011 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LDHCP07864 332 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL6A2P12110 1019 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL8A1P27658 744 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HTR3AP46098 478 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDCD1Q15116 288 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCORLQ8N3X6 602 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSRNP2Q9H175 543 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A5Q9H3V2 200 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARMT1Q9H993 441 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SP110Q9HB58 689 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AK9Q5TCS8 1911 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNK3O14649 394 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKAB2O43741 272 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OFD1O75665 1012 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DGKIO75912 1065 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MBD4O95243 580 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FPR2P25090 351 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NF2P35240 595 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADD2P35612 726 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEKQ02763 1124 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNFAIP1Q13829 316 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZPBP2Q6X784 338 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM151AQ8WW52 585 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms