RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM212AQ96EL1 285 aa16.46■□□□□ 0.23
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ASB7Q9H672 318 aa16.46■□□□□ 0.23
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.46■□□□□ 0.23
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UCHL3P15374 230 aa16.42■□□□□ 0.22
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PIK3CAP42336 1068 aa16.42■□□□□ 0.22
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRIM60Q495X7 471 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNAJC7Q99615 494 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.42■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.42■□□□□ 0.22
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