RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449029.1

VENTXP4-201, Transcript of VENT homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene VENTXP4, Length 958 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXP4-201ENST00000449029 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 TCF15Q12870 199 aa14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PSMD5Q16401 504 aa14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 POLD4Q9HCU8 107 aa14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.69□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 TECTAO75443 2155 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PTGESO14684 152 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 LAMP2P13473 410 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 FSHRP23945 695 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 NPTX2P47972 431 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 MCM2P49736 904 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ECM1Q16610 540 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 RTP2Q5QGT7 225 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 HASPINQ8TF76 798 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ACAP3Q96P50 834 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 POLIQ9UNA4 740 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 USP20Q9Y2K6 914 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 E9PMD0 336 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 H0YCG3 227 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 KIF4AO95239 1232 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ELF1P32519 619 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 RAB33AQ14088 237 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 NBR1Q14596 966 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 SIX5Q8N196 739 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 KCND2Q9NZV8 630 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 HIP1RO75146 1068 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PAPLNO95428 1278 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 C8AP07357 584 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 MCF2P10911 925 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 SRFP11831 508 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 HOXA9P31269 272 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 OR1D2P34982 312 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 GRM5P41594 1212 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 SHDQ96IW2 340 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 KIF2CQ99661 725 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 H7C4K7 107 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 GFRA3O60609 400 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 CFHP08603 1231 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 AOC1P19801 751 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 SCP2P22307 547 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 FGFR3P22607 806 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 GUCY2CP25092 1073 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 CDC25AP30304 524 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 CLCNKBP51801 687 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 OSTNP61366 133 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 UPP1Q16831 310 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 MYADMQ96S97 322 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 CDH7Q9ULB5 785 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP4-201ENST00000449029 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP4-201ENST00000449029 SFI1A8K8P3 1242 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP4-201ENST00000449029 SLC16A4O15374 487 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP4-201ENST00000449029 CLDN3O15551 220 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP4-201ENST00000449029 SLC26A4O43511 780 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms