RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ITIH1P19827 911 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CIITAP33076 1130 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MFAP3P55082 362 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SSTP61278 116 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 COPZ1P61923 177 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MAPRE2Q15555 327 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PTPN21Q16825 1174 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 C4orf46Q504U0 113 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 HECTD3Q5T447 861 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 LAYNQ6UX15 382 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 C3orf67Q6ZVT6 689 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 DPH5Q9H2P9 285 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 MAPK11Q15759 364 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 PERM1Q5SV97 790 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 PLCG2P16885 1265 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MAPK4P31152 587 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ARPP19P56211 112 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF45Q02386 682 aa5.89□□□□□ -1.47
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