RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 KIF4AO95239 1232 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 EDN1P05305 212 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PLA2G4BP0C869 781 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 MCF2P10911 925 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PLS3P13797 630 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 GRM5P41594 1212 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 KCNK18Q7Z418 384 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 DAW1Q8N136 415 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 FBXL6Q8N531 539 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PLIN2Q99541 437 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 SLC16A4O15374 487 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 B3GAT3O94766 335 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 ACAP3Q96P50 834 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PNMA5Q96PV4 448 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 CDT1Q9H211 546 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 SFI1A8K8P3 1242 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 TGM5O43548 720 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 SCP2P22307 547 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 OSTNP61366 133 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 MAPK7Q13164 816 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PSMD5Q16401 504 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 RTP2Q5QGT7 225 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 LIN9Q5TKA1 542 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 TOM1L1O75674 476 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 SPATA31D3P0C874 917 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 SLC12A3P55017 1021 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 NAB2Q15742 525 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 CLUHO75153 1309 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 RFPL2O75678 378 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 MYBP10242 640 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 CLCNKBP51801 687 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 ZPBP2Q6X784 338 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 ASIC4Q96FT7 647 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 BICD1Q96G01 975 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 CLDN3O15551 220 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 BRD1O95696 1058 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 ASGR2P07307 311 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 ABCD1P33897 745 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 CUL4AQ13619 759 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 UPP1Q16831 310 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 LILRA6Q6PI73 481 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CCDC78-204ENST00000439619 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 ZMYND10O75800 440 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 FAM13AO94988 1023 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 PROZP22891 400 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 TDGQ13569 410 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 KYAT1Q16773 422 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 XKR4Q5GH76 650 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 GPBP1Q86WP2 473 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 CEP120Q8N960 986 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 SNX27Q96L92 541 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC78-204ENST00000439619 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms