RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPAN7P41732 249 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDK8P49336 464 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNAP25P60880 206 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LMNB2Q03252 620 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MLC1Q15049 377 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf27AQ580R0 203 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR63Q8IWG1 891 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FLCNQ8NFG4 579 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TOP1MTQ969P6 601 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCLT1Q96NL6 688 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDH19Q9H159 772 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBSNQ9H1K0 784 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM170AA1A519 330 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F5H6K3 240 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIK3R2O00459 728 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHDP01880 384 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMP3P08254 477 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALAS1P13196 640 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM27P14373 513 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HALP42357 657 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBED6P86452 979 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUCB1Q02818 461 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLRC3Q07444 240 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP2R5BQ15173 497 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNNI3KQ59H18 835 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPECC1Q5M775 1068 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARMC3Q5W041 872 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEP135Q66GS9 1140 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SESTD1Q86VW0 696 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FIBCD1Q8N539 461 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BSNDQ8WZ55 320 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL4A3Q01955 1670 aa6.4□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ITPR1Q14643 2758 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 E2F8A0AVK6 867 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PER2O15055 1255 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ITGB1P05556 798 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDE6AP16499 860 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AOC1P19801 751 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALAS2P22557 587 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIK3CAP42336 1068 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOX9P48436 509 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLCN5P51795 746 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OAZ1P54368 228 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC158Q5M9N0 1113 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.4□□□□□ -1.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IL31Q6EBC2 164 aa6.4□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms