RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 KSR1Q8IVT5 923 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 FBF1Q8TES7 1133 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 SEL1LQ9UBV2 794 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 SPOPO43791 374 aa15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ITIH2P19823 946 aa15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CHKAP35790 457 aa15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 KRT17Q04695 432 aa15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 FIZ1Q96SL8 496 aa15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.96■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CIITAP33076 1130 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 STAT2P52630 851 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF720Q7Z2F6 126 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 TPH2Q8IWU9 490 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 SAAL1Q96ER3 474 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB39O15060 712 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ENTPD3O75355 529 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 RWDD2BP57060 319 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 STRN3Q13033 797 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 TAF11Q15544 211 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 SNF8Q96H20 258 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.95■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 POTEJP0CG39 1038 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 PARP6Q2NL67 630 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 FAM178BQ8IXR5 827 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 EXOC3O60645 756 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 HIP1RO75146 1068 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 GZMAP12544 262 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 SGO2Q562F6 1265 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 TUFT1Q9NNX1 390 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 SIPA1L1O43166 1804 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 SLX4Q8IY92 1834 aa15.94■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 FSCN2O14926 492 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 THAP12O43422 761 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ATP5HO75947 161 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ABL2P42684 1182 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 KYNUQ16719 465 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 TEX9Q8N6V9 391 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 HSD17B14Q9BPX1 270 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 NUP85Q9BW27 656 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 A6NHS1 94 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 HGSO14964 777 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 TAC1P20366 129 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CAV1Q03135 178 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CETN1Q12798 172 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 PLVAPQ9BX97 442 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 LRMDAQ9H2I8 198 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 ACTL7BQ9Y614 415 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 EMSYQ7Z589 1322 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CLDN3O15551 220 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CYP1A2P05177 515 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CHRNB2P17787 502 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 GNAZP19086 355 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 IVDP26440 423 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 LMNB2Q03252 620 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 PTK6Q13882 451 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 CYP4X1Q8N118 509 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 BTBD6Q96KE9 485 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 WDR18Q9BV38 432 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 PITPNM3Q9BZ71 974 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.93■□□□□ 0.14
TOP3B-206ENST00000436282 NINJ2Q9NZG7 142 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms