RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 MED21Q13503 144 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CYTH1Q15438 398 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MOSPD1Q9UJG1 213 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 UBR2Q8IWV8 1755 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNA1FO60840 1977 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PP2D1A8MPX8 630 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXP2O15409 715 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DAB1O75553 588 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MTF1Q14872 753 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CNGA3Q16281 694 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SUSD4Q5VX71 490 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CYB5R4Q7L1T6 521 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ASIC4Q96FT7 647 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CASS4Q9NQ75 786 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO1DO94832 1006 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GPC3P51654 580 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNQ4P56696 695 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT17Q04695 432 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KDSRQ06136 332 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP55Q53EZ4 464 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SRLQ86TD4 932 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DDIASQ8IXT1 998 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 AGR3Q8TD06 166 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 EMSYQ7Z589 1322 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MRC1P22897 1456 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC27P30260 824 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 BLVRAP53004 296 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SHC4Q6S5L8 630 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CNPY4Q8N129 248 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC44A5Q8NCS7 719 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF229Q9UJW7 825 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 NEDD4P46934 1319 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SNAP23O00161 211 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SCP2P22307 547 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNB3P54284 484 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KLC1Q07866 573 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNB1Q14721 858 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 LY9Q9HBG7 655 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 BATF3Q9NR55 127 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PNMA3Q9UL41 463 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 POLIQ9UNA4 740 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 AURKCQ9UQB9 309 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 NRAPQ86VF7 1730 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 EP400Q96L91 3159 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L10C9JJH3 530 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 NNMTP40261 264 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNJ6P48051 423 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB10P48595 397 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ERFP50548 548 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ALX1Q15699 326 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP95Q96GE4 821 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SIK2Q9H0K1 926 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 BARHL2Q9NY43 387 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 FGFR4P22455 802 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TAP1Q03518 808 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RUBCNQ92622 972 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PARVAQ9NVD7 372 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PKD2L2Q9NZM6 624 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 F5H423 210 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GNAT1P11488 350 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RANBP1P43487 201 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms