RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLOD3O60568 738 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FKTNO75072 461 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBX18O95935 607 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WNT11O96014 354 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TGFB1P01137 390 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NCAM1P13591 858 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATP1A3P13637 1013 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADAM9Q13443 819 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPIDRQ14159 915 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPARCL1Q14515 664 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AOC3Q16853 763 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC45A4Q5BKX6 768 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GGT6Q6P531 493 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GAREM2Q75VX8 874 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAML1Q92585 1016 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GBP4Q96PP9 640 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 G6PC3Q9BUM1 346 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BRIP1Q9BX63 1249 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AKTIPQ9H8T0 292 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BTG4Q9NY30 223 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FBXO10Q9UK96 956 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.44□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIAA0556O60303 1618 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A0A6YYJ9 748 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM234BA2RU67 622 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A6NLC8 198 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRIT1O00522 736 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NFIBO00712 420 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ESR1P03372 595 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FUCA1P04066 466 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ITGA5P08648 1049 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KITP10721 976 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AOAHP28039 575 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POLD1P28340 1107 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADMP35318 185 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HOXD12P35452 270 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC6A11P48066 632 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC6A9P48067 706 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR15P49685 360 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FLT3LGP49771 235 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TERF1P54274 439 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CORO7P57737 925 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCAF7P61962 342 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADCY2Q08462 1091 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF827Q17R98 1081 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UVSSAQ2YD98 709 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMC6Q7Z403 805 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLCO6A1Q86UG4 719 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C3orf20Q8ND61 904 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FERMT2Q96AC1 680 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EID2BQ96D98 161 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC35A4Q96G79 324 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM167AQ96KS9 214 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYRFLQ96LU7 910 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 JMJD8Q96S16 334 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CEP41Q9BYV8 373 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms