RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409543.6

TSPAN4-209, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,031 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-209ENST00000409543 RAD54LQ92698 747 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 SNX21Q969T3 373 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 B3GALT6Q96L58 329 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 FNIP2Q9P278 1114 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 DPP7Q9UHL4 492 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 TOM1L1O75674 476 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 WEE2P0C1S8 567 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 NCKAP1LP55160 1127 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 CREMQ03060 361 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 MCM6Q14566 821 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 GPR149Q86SP6 731 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 EDAQ92838 391 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 UROC1Q96N76 676 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 ACAP3Q96P50 834 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 REEP2Q9BRK0 252 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 STX6O43752 255 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 GLUD1P00367 558 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 SCP2P22307 547 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 ZNF131P52739 623 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 OSTNP61366 133 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 HASPINQ8TF76 798 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 EPSTI1Q96J88 318 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 TTPALQ9BTX7 342 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 TRIP11Q15643 1979 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 FAM13AO94988 1023 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 DDIT3P35638 169 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 RTP2Q5QGT7 225 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 USP49Q70CQ1 688 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 TRIOO75962 3097 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 PLXNA3P51805 1871 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 KCNE1P15382 129 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 CLCNKBP51801 687 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 MCL1Q07820 350 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 UPP1Q16831 310 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 SPECC1Q5M775 1068 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 LILRA6Q6PI73 481 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 PALB2Q86YC2 1186 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 MYCT1Q8N699 235 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 SNX27Q96L92 541 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 PARVGQ9HBI0 331 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-209ENST00000409543 C2CD4DB7Z1M9 353 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 CLDN3O15551 220 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 TGM5O43548 720 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 B3GAT3O94766 335 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 ZXDAP98168 799 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 SLC39A14Q15043 492 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 PTPN21Q16825 1174 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 PDXDC1Q6P996 788 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 CEP57Q86XR8 500 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 CLIC6Q96NY7 704 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 USP28Q96RU2 1077 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 CNTN3Q9P232 1028 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 STK17AQ9UEE5 414 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 TBX20Q9UMR3 447 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 USTQ9Y2C2 406 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-209ENST00000409543 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms