RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 STX10O60499 249 aa21.81■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 FECHP22830 423 aa21.81■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 MGAT3Q09327 533 aa21.81■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PDXDC1Q6P996 788 aa21.81■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 CGRRF1Q99675 332 aa21.81■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.81■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 CITO14578 2027 aa21.81■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 USP27XA6NNY8 438 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 M0QZ92 97 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 DNM1LO00429 736 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 USP37Q86T82 979 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 RSPH3Q86UC2 560 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 P4HA2O15460 535 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 GTF2H1P32780 548 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 NOTUMQ6P988 496 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.8■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PMM2O15305 246 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 VNN1O95497 513 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ENPEPQ07075 957 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PTK7Q13308 1070 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 MEA1Q16626 185 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ZACNQ401N2 412 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 RPAINQ86UA6 219 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 KAT5Q92993 513 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 IQCDQ96DY2 449 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 DESI2Q9BSY9 194 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.79■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 LACTBL1A8MY62 500 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 CLTAP09496 248 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ARID5AQ03989 594 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 CETN1Q12798 172 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 BIRC3Q13489 604 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 RAB20Q9NX57 234 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ARVCFO00192 962 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP6O43182 974 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 NFICP08651 508 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 UBXN11Q5T124 520 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ZNF333Q96JL9 665 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 GPR88Q9GZN0 384 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 RNF19AQ9NV58 838 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 SNTG2Q9NY99 539 aa21.78■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 RPS6KA5O75582 802 aa21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 JAM2P57087 298 aa21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 WDR49Q8IV35 697 aa21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 TATDN2Q93075 761 aa21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 HLA-DRAP01903 254 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 GHRP10912 638 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 JADE1Q6IE81 842 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 SPAG5Q96R06 1193 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 APOL6Q9BWW8 343 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 NRDCO43847 1150 aa21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ODC1-202ENST00000405333 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms