RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403915.5

KCNS3-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-202ENST00000403915 ASRGL1Q7L266 308 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CCDC25Q86WR0 208 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 IQCKQ8N0W5 287 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 FBXL16Q8N461 479 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 FAM89AQ96GI7 184 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 POLHQ9Y253 713 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 A6NL46 340 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 E2F3O00716 465 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 OR6B1O95007 311 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 HSPA6P17066 643 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 TRIM23P36406 574 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 OLR1P78380 273 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PPARDQ03181 441 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 UBE4AQ14139 1066 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 Q3ZCU0 254 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 VWA3BQ502W6 1294 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 DENND2CQ68D51 928 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 FERMT3Q86UX7 667 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CAVIN3Q969G5 261 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 FAR2Q96K12 515 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PHF12Q96QT6 1004 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PLGRKTQ9HBL7 147 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.85□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PASKQ96RG2 1323 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 SMCO2A6NFE2 343 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CAPN8A6NHC0 703 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 GPC4O75487 556 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 POU2F1P14859 743 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 RASA1P20936 1047 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 C2orf54Q08AI8 447 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 NPTX1Q15818 432 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 Q3C1V9 767 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 GGT6Q6P531 493 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 SATL1Q86VE3 508 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 GMLQ99445 158 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 USP29Q9HBJ7 922 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.84□□□□□ -0.83
KCNS3-202ENST00000403915 A0A0U1RQJ8 604 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 F8W810 466 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 AQP9O43315 295 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 FUCA1P04066 466 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 RSPH10BP0C881 870 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 GJB2P29033 226 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 CD300CQ08708 224 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 SQLEQ14534 574 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 GALNTL6Q49A17 601 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.83□□□□□ -0.84
KCNS3-202ENST00000403915 SFR1Q86XK3 245 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms