RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 MKNK1Q9BUB5 465 aa36.18■■■■□ 3.38
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CSNK1E-204ENST00000403904 CYP24A1Q07973 514 aa36.17■■■■□ 3.38
CSNK1E-204ENST00000403904 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
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CSNK1E-204ENST00000403904 FAM200AQ8TCP9 573 aa36.17■■■■□ 3.38
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CSNK1E-204ENST00000403904 PDE11AQ9HCR9 933 aa36.16■■■■□ 3.38
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CSNK1E-204ENST00000403904 XKR4Q5GH76 650 aa36.12■■■■□ 3.37
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CSNK1E-204ENST00000403904 BFSP1Q12934 665 aa36.1■■■■□ 3.37
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CSNK1E-204ENST00000403904 NFICP08651 508 aa36.09■■■■□ 3.37
CSNK1E-204ENST00000403904 MARSP56192 900 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CSNK1E-204ENST00000403904 SURF1Q15526 300 aa36.09■■■■□ 3.37
CSNK1E-204ENST00000403904 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CSNK1E-204ENST00000403904 KIF12Q96FN5 646 aa36.09■■■■□ 3.37
CSNK1E-204ENST00000403904 FAM84AQ96KN4 292 aa36.09■■■■□ 3.37
CSNK1E-204ENST00000403904 ZBED2Q9BTP6 218 aa36.09■■■■□ 3.37
CSNK1E-204ENST00000403904 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
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