RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 TNNI1P19237 187 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 FMO5P49326 533 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 MXI1P50539 228 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 CCL23P55773 120 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 IQCDQ96DY2 449 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 SNTG2Q9NY99 539 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 DERAQ9Y315 318 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 ITGA4P13612 1032 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 MYL7Q01449 175 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 KRT39Q6A163 491 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC24A5Q71RS6 500 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM212AQ96EL1 285 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 SCLYQ96I15 445 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 SNX27Q96L92 541 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 TTC26A0AVF1 554 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 DLG4P78352 724 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 INTS13Q9NVM9 706 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 C2CD2Q9Y426 696 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-202ENST00000397396 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 MGEA5O60502 916 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 RECQL4O94761 1208 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM191BP0C7N4 346 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC10A6Q3KNW5 377 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 MFSD5Q6N075 450 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 GBP6Q6ZN66 633 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 VSTM4Q8IW00 320 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 DRC7Q8IY82 874 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM192Q8IY95 271 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 CNTN3Q9P232 1028 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 PARP2Q9UGN5 583 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TEX33O43247 280 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 EOMESO95936 686 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TNNC2P02585 160 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 GCLMP48507 274 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 PPP3CAQ08209 521 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TRIM14Q14142 442 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 GPNMBQ14956 572 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 APOL6Q9BWW8 343 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 HES2Q9Y543 173 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 LACTBL1A8MY62 500 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 C9IYK1 514 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 EFCAB14O75071 495 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 PBX1P40424 430 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 SYCP1Q15431 976 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 ECHDC2Q86YB7 292 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 NUP58Q9BVL2 599 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TPM1P09493 284 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 CBWD6Q4V339 395 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 XKR4Q5GH76 650 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 GCNT4Q9P109 453 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 CITO14578 2027 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 KCNE1P15382 129 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 AKAP5P24588 427 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM189BP81408 668 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.673e-9■■■□□ 16.8
TSPAN4-202ENST00000397396 BIRC3Q13489 604 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 IKBKEQ14164 716 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 ZACNQ401N2 412 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-202ENST00000397396 JADE1Q6IE81 842 aa25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms