RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.59□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.59□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.59□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.59□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
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C6orf48-208ENST00000395788 EMSYQ7Z589 1322 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.58□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 CDK2AP1O14519 115 aa6.58□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 TNNT1P13805 278 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ABCD1P33897 745 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 GRB14Q14449 540 aa6.58□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 PTPN14Q15678 1187 aa6.58□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 OGFOD2Q6N063 350 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 BSNDQ8WZ55 320 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 FAM167AQ96KS9 214 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 CEP170P1Q96L14 293 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 FBXL18Q96ME1 805 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 GPR20Q99678 358 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 GANQ9H2C0 597 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 VTA1Q9NP79 307 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF302Q9NR11 478 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 CEP72Q9P209 647 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MYO6Q9UM54 1294 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 TBX20Q9UMR3 447 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 USP20Q9Y2K6 914 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.58□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF236Q9UL36 1845 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PASKQ96RG2 1323 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 H0YCG3 227 aa6.57□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 P4HA2O15460 535 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 LCA5LO95447 670 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 GGPS1O95749 300 aa6.57□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 SPINK2P20155 84 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ADORA2AP29274 412 aa6.57□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 EMC2Q15006 297 aa6.57□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.57□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 ARMCX2Q7L311 632 aa6.57□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 KSR1Q8IVT5 923 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SCFD2Q8WU76 684 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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