RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 TLDC2A0PJX2 215 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 GRIN3BO60391 1043 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 ECEL1O95672 775 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 AGTP01019 485 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 MMP13P45452 471 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 PLCB4Q15147 1175 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 FBXW10Q5XX13 1052 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 NSMFQ6X4W1 530 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 GPD1LQ8N335 351 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 AZI2Q9H6S1 392 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD13-201ENST00000392539 FSCN2O14926 492 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 GCNT1Q02742 428 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CPLX4Q7Z7G2 160 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MDM1Q8TC05 714 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 SLCO2A1Q92959 643 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CABS1Q96KC9 395 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CEP170P1Q96L14 293 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 PTPN22Q9Y2R2 807 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 PARP14Q460N5 1801 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 FDX1P10109 184 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 KRT5P13647 590 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 GARTP22102 1010 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CHMP6Q96FZ7 201 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 RIPK2O43353 540 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 DRD4P21917 467 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CCND2P30279 289 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CALCOCO2Q13137 446 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 DGKZQ13574 1117 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ICE2Q659A1 982 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 GPRASP2Q96D09 838 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 KCNJ1P48048 391 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 PPP1R7Q15435 360 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 SELENOSQ9BQE4 189 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 GABBR1Q9UBS5 961 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 DLATP10515 647 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CHN1P15882 459 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MAPK4P31152 587 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MAIP1Q8WWC4 291 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MAFGO15525 162 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 FGFR4P22455 802 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 VSIG10LQ86VR7 867 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MCPH1Q8NEM0 835 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 WHRNQ9P202 907 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ANAPC7Q9UJX3 599 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CLDN3O15551 220 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 RTP1P59025 263 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 SGO2Q562F6 1265 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM11Q96F44 468 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 C1orf112Q9NSG2 853 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 SMIM23A6NLE4 172 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 UNGP13051 313 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 CXCL9Q07325 125 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF677Q86XU0 584 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 STK32BQ9NY57 414 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MYBL1P10243 752 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MCOLN2Q8IZK6 566 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 P3H4Q92791 437 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 TEPSINQ96N21 525 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ADAM7Q9H2U9 754 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 RNF146Q9NTX7 359 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 RASGRF2O14827 1237 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF862O60290 1169 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 DGAT1O75907 488 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 STBD1O95210 358 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 SCP2P22307 547 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ABCD1P33897 745 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MAN1A1P33908 653 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 SLC1A1P43005 524 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 SOX10P56693 466 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 MTMR2Q13614 643 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 BICD1Q96G01 975 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 FAM213AQ9BRX8 229 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 H0YCG3 227 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 VWA5AO00534 786 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXD13-201ENST00000392539 PSAPP07602 524 aa28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms