RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 HLA-DRAP01903 254 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 RARBP10826 455 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 PAMP19021 973 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 MX2P20592 715 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNJ1P48048 391 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 POU5F1BQ06416 359 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 HIF1AQ16665 826 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 GRAMD1BQ3KR37 738 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNV1Q6PIU1 500 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 REXO1L1PQ8IX06 675 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 PLAGL2Q9UPG8 496 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 SKIP12755 728 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 COMTP21964 271 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 NOP14P78316 857 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP69BQ9UJL9 534 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PQJ5 194 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 MKNK1Q9BUB5 465 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8RI6L899 631 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 RAD51CO43502 376 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 TAP1Q03518 808 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 EHD2Q9NZN4 543 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 NVLO15381 856 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R37O75864 691 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 ERVK-24P63145 666 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 RUSC1Q9BVN2 902 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 MED24O75448 989 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 COPS2P61201 443 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A087X0T9 212 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP3K7O43318 606 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM228BP0C875 321 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 COPB2P35606 906 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 MTM1Q13496 603 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 NUDCD3Q8IVD9 361 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 MCEEQ96PE7 176 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 SPON2Q9BUD6 331 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 WEE2P0C1S8 567 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 CASP7P55210 303 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.56e-7■■■■□ 26.6
SH3BP4-202ENST00000392011 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 SMYD3Q9H7B4 428 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ETNK1Q9HBU6 452 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 DUSP10Q9Y6W6 482 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 HAUS5O94927 633 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 CHEK2O96017 543 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 GYS1P13807 737 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 TAC1P20366 129 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 SERPINI1Q99574 410 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 GRAP2O75791 330 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 TYK2P29597 1187 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ARFIP2P53365 341 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF560Q96MR9 790 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 SENP7Q9BQF6 1050 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 FUCA2Q9BTY2 467 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 AP5Z1O43299 807 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 PHF2O75151 1096 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM24O75264 130 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 DPEP1P16444 411 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 P3H1Q32P28 736 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 AFG1LQ8WV93 481 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 TNIP3Q96KP6 325 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC26A4O43511 780 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms