RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 EMBQ6PCB8 327 aa21.58■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 SPATA33Q96N06 139 aa21.58■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.58■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PNMA3Q9UL41 463 aa21.58■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PTPRJQ12913 1337 aa21.58■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CCDC188H7C350 402 aa21.57■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 SLC26A2P50443 739 aa21.57■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.57■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.57■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.57■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CGRRF1Q99675 332 aa21.57■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 MED4Q9NPJ6 270 aa21.57■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 FAM170AA1A519 330 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 KRT5P13647 590 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PIK3CAP42336 1068 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PLCB4Q15147 1175 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CARD9Q9H257 536 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PLXNB2O15031 1838 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ASB14A6NK59 587 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 GRIN3BO60391 1043 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 MSCO60682 206 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 VNN1O95497 513 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ALG6Q9Y672 507 aa21.56■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 UNCXA6NJT0 531 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CLDN3O15551 220 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 RAD51CO43502 376 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 GUCY2DQ02846 1103 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 BIRC3Q13489 604 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 TTLL4Q14679 1199 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 FAM71BQ8TC56 605 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CAVIN3Q969G5 261 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 TOM1L1O75674 476 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CYP1A2P05177 515 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CYP2C8P10632 490 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 COPS5Q92905 334 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CCDC102AQ96A19 550 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 EFCC1Q9HA90 598 aa21.55■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.54■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 KRIT1O00522 736 aa21.54■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 FAM189A1O60320 539 aa21.54■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF677Q86XU0 584 aa21.54■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.54■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.54■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.54■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.54■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PAK2Q13177 524 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 NNTQ13423 1086 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 RNF149Q8NC42 400 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 BPIFB4P59827 614 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CCNA1P78396 465 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 GRM1Q13255 1194 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 MAPK6Q16659 721 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ARMCX2Q7L311 632 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF653Q96CK0 615 aa21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 HBP1O60381 514 aa21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 PRKCBP05771 671 aa21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 AP3M2P53677 418 aa21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 CLUL1Q15846 466 aa21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SERBP1-201ENST00000361219 ALG3Q92685 438 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms