RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM17Q9Y577 477 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PCNTO95613 3336 aa22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 F8VZ95 297 aa22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 GRK4P32298 578 aa22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 KIF11P52732 1056 aa22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.2■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 A0A0U1RQJ8 604 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 AKR1B10O60218 316 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 OFD1O75665 1012 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PIK3CAP42336 1068 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ZACNQ401N2 412 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 NME8Q8N427 588 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CENPFP49454 3210 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 GFPT2O94808 682 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 SOX5P35711 763 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 KRT83P78385 493 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 SURF1Q15526 300 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM192Q8IY95 271 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 NT5C1BQ96P26 610 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.19■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 A0A1B0GUA9 196 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 HLA-DRAP01903 254 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 STAG3L1P0CL83 205 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 FERP16591 822 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 SNX17Q15036 470 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 WDR49Q8IV35 697 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 GPR88Q9GZN0 384 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PHACTR2O75167 634 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CXCL8P10145 99 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CYP27A1Q02318 531 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 SPA17Q15506 151 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.18■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CLTAP09496 248 aa22.17■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 AP3M2P53677 418 aa22.17■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 KIAA1328Q86T90 577 aa22.17■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF592Q92610 1267 aa22.17■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 KAT5Q92993 513 aa22.17■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 EVI5O60447 810 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 VNN1O95497 513 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 M0QZ92 97 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF263O14978 683 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CLSTN1O94985 981 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 IL18RAPO95256 599 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 NPTXRO95502 500 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PRKCIP41743 596 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ACLYP53396 1101 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 MFAP3P55082 362 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PTK2Q05397 1052 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 KYAT1Q16773 422 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 WDR44Q5JSH3 913 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 RSPH3Q86UC2 560 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 SESTD1Q86VW0 696 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 HELQQ8TDG4 1101 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 TATDN2Q93075 761 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 GRIN2DO15399 1336 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
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