RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 PIK3CAP42336 1068 aa25.73■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.73■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 SEC14L1Q92503 715 aa25.73■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 NR2E1Q9Y466 385 aa25.73■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.72■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 BIRC3Q13489 604 aa25.71■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 CD302Q8IX05 232 aa25.71■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 CD101Q93033 1021 aa25.71■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 LRRC45Q96CN5 670 aa25.71■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 OTUD5Q96G74 571 aa25.71■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 RAB17Q9H0T7 212 aa25.71■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 NEUROG2Q9H2A3 272 aa25.71■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25.71■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 IRF6O14896 467 aa25.7■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 DR1Q01658 176 aa25.7■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 SEL1L2Q5TEA6 688 aa25.7■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM134Q9H6X4 195 aa25.7■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 PTPRJQ12913 1337 aa25.7■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 SPOPO43791 374 aa25.7■■□□□ 1.7
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TRIM54-201ENST00000296098 AADACL2Q6P093 401 aa25.69■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF677Q86XU0 584 aa25.69■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.69■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 CGRRF1Q99675 332 aa25.69■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM51Q9BSJ1 452 aa25.69■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.69■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 A0A0B4J269 797 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 EDN1P05305 212 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 CTNNA2P26232 953 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 COPB2P35606 906 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 BTBD6Q96KE9 485 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 DPH5Q9H2P9 285 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 PLAAQ9Y263 795 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 CNMDO75829 334 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 VNN1O95497 513 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 CALCAP01258 141 aa25.68■■□□□ 1.7
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TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 FAM167AQ96KS9 214 aa25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 FAM187AA6NFU0 413 aa25.67■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 ADCY3O60266 1144 aa25.67■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 PHF2O75151 1096 aa25.67■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 MAFO75444 373 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 HSD17B3P37058 310 aa25.67■■□□□ 1.7
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TRIM54-201ENST00000296098 ERO1BQ86YB8 467 aa25.67■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 FBXO41Q8TF61 875 aa25.67■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 AZI2Q9H6S1 392 aa25.67■■□□□ 1.7
TRIM54-201ENST00000296098 PPME1Q9Y570 386 aa25.67■■□□□ 1.7
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