RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 PI15O43692 258 aa21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 ST18O60284 1047 aa21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 CFHP08603 1231 aa21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 AOC1P19801 751 aa21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 PTGDRQ13258 359 aa21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.59■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 K7ERI5 159 aa21.58■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 LAMP2P13473 410 aa21.58■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.58■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 NXPE3Q969Y0 559 aa21.58■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 RAB34Q9BZG1 259 aa21.58■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 WNT16Q9UBV4 365 aa21.58■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 STK24Q9Y6E0 443 aa21.58■■□□□ 1.05
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC169A6NNP5 214 aa21.57■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 E9PMD0 336 aa21.57■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 LIN9Q5TKA1 542 aa21.57■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 PDXDC1Q6P996 788 aa21.57■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.57■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.57■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.57■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 PP2D1A8MPX8 630 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 PROB1E7EW31 1015 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 ADAM12O43184 909 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 B3GAT3O94766 335 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 C8AP07357 584 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 SRFP11831 508 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 FSHRP23945 695 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 PEX3P56589 373 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 KRT79Q5XKE5 535 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 DNM3Q9UQ16 869 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 VWA8A3KMH1 1905 aa21.56■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CACNA1HO95180 2353 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 KRBA1A5PL33 1030 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 STK25O00506 426 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 LAD1O00515 517 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 FGFR3P22607 806 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 NBL1P41271 181 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 NPTX2P47972 431 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CLCNKBP51801 687 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CEP120Q8N960 986 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CA14Q9ULX7 337 aa21.55■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 ANHXE9PGG2 379 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 HIP1RO75146 1068 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CDC25AP30304 524 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 OR1D2P34982 312 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 GRM5P41594 1212 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 NTHL1P78549 312 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 HTR4Q13639 388 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 RAB33AQ14088 237 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 IL17AQ16552 155 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 DAW1Q8N136 415 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 UROC1Q96N76 676 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CDT1Q9H211 546 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 POLIQ9UNA4 740 aa21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CCL16O15467 120 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 RFX1P22670 979 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 HOXA9P31269 272 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 PRPHP41219 470 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 OSTNP61366 133 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 UPP1Q16831 310 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 C8orf34Q49A92 452 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 GPR152Q8TDT2 470 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 DRC1Q96MC2 740 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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