RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RASA4BC9J798 803 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RASA4O43374 803 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 BANF1O75531 89 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CHRNB2P17787 502 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SESN3P58005 492 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PPP2R5AQ15172 486 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 WDR44Q5JSH3 913 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 KRT39Q6A163 491 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SV2AQ7L0J3 742 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CYP4X1Q8N118 509 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SPOCK2Q92563 424 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM143Q96AN5 459 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PFASO15067 1338 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CIITAP33076 1130 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PTGIRP43119 386 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 FMO1Q01740 532 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJC3Q13217 504 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ZBTB33Q86T24 672 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 FIZ1Q96SL8 496 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RAB20Q9NX57 234 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PLS3P13797 630 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ADRA2BP18089 450 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SLMAPQ14BN4 828 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.3□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MYBL1P10243 752 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 LIG4P49917 911 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NLRX1Q86UT6 975 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CCT6BQ92526 530 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MBOAT7Q96N66 472 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PARP2Q9UGN5 583 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SCN7AQ01118 1682 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PIK3R2O00459 728 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CES2O00748 559 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PEX10O60683 326 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PEX19P40855 299 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PIK3CAP42336 1068 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.127e-7■■■■■ 39.4
TMOD1-201ENST00000259365 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MYH11P35749 1972 aa14.29□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DIAPH2O60879 1101 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SUN1O94901 812 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NPTX2P47972 431 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ORC1Q13415 861 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NEDD9Q14511 834 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 KIF22Q14807 665 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 P3H1Q32P28 736 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RFX8Q6ZV50 586 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PPP2R5CQ13362 524 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CNGA2Q16280 664 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PPP2R5EQ16537 467 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TKFCQ3LXA3 575 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 LMO3Q8TAP4 145 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM237Q96Q45 408 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 AGTP01019 485 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RARGP13631 454 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC77Q9BR77 488 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ZWILCHQ9H900 591 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms