RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 VSIG1Q86XK7 387 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 K7ENM7 598 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP3A4P08684 503 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF131P52739 623 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 Q4G0T1 1027 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTC4O95801 387 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERFP50548 548 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 JAG1P78504 1218 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 AMNQ9BXJ7 453 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 HIP1RO75146 1068 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCRP11274 1271 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 RRM1P23921 792 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 SATB1Q01826 763 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 LINGO3P0C6S8 592 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 EPHB2P29323 1055 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 SREBF1P36956 1147 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 RWDD2BP57060 319 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 DAW1Q8N136 415 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEMA4DQ92854 862 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 AKT1S1Q96B36 256 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 DMAC2Q9NW81 257 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 F5H6K3 240 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 ENTPD5O75356 428 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 IVDP26440 423 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAD23BP54727 409 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 FMO1Q01740 532 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFT74Q96LB3 600 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHKBQ9Y259 395 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 RASA4BC9J798 803 aa22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 RASA4O43374 803 aa22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 BMP3P12645 472 aa22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 GAP43P17677 238 aa22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 SAAL1Q96ER3 474 aa22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRIK3Q13003 919 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC174Q6PII3 467 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 SP8Q8IXZ3 490 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINB12Q96P63 405 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 UNC5CO95185 931 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 VAMP7P51809 220 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM20AQ96MK3 541 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1W2PRG0 241 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR91A4D1P6 747 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.216e-7■■□□□ 14.2
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARP10275 920 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 AP3B2Q13367 1082 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP1B1Q16678 543 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 NDUFB10O96000 172 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLF2Q8IX21 1173 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms