RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 IWS1Q96ST2 819 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 GPC3P51654 580 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 CAV1Q03135 178 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 CSRNP1Q96S65 589 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.67■■□□□ 1.38
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HTATSF1-201ENST00000218364 O00370 1275 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 PLA2G6O60733 806 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 LYPLA2O95372 231 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 GJB6O95452 261 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 ALADP13716 330 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 NQO1P15559 274 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 CREB1P16220 341 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT39Q6A163 491 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 VEZTQ9HBM0 779 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 BNIP1Q12981 228 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 NSMFQ6X4W1 530 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 EBF2Q9HAK2 575 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 ASIC3Q9UHC3 531 aa23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 CLTAP09496 248 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 NCKAP1LP55160 1127 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 TIPINQ9BVW5 301 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 CHST7Q9NS84 486 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 ECE2O60344 883 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 KIFAP3Q92845 792 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 MGARPQ8TDB4 240 aa23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 MASTLQ96GX5 879 aa23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 LGALS13Q9UHV8 139 aa23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SORBS3O60504 671 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 HSD17B4P51659 736 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGA8P53708 1063 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX1Q13596 522 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 LDHDQ86WU2 507 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 PARD3BQ8TEW8 1205 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ECT2Q9H8V3 914 aa23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.373e-10■■■■■ 153.8
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HTATSF1-201ENST00000218364 BAG6P46379 1132 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5C1BQ96P26 610 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 DCLK3Q9C098 648 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SCN9AQ15858 1988 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 COPS2P61201 443 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MPP2Q14168 576 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 KYNUQ16719 465 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA21Q7Z572 469 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM160B2Q86V87 743 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 AKT1S1Q96B36 256 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.63■■□□□ 1.37
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HTATSF1-201ENST00000218364 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC16A4O15374 487 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ADSSP30520 456 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPK4P31152 587 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNJ2P63252 427 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TNIP1Q15025 636 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 DONSONQ9NYP3 566 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 NINJ2Q9NZG7 142 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 NEU2Q9Y3R4 380 aa23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GAS8O95995 478 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 BRAFP15056 766 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC1A1P43005 524 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TMC2Q8TDI7 906 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ANAPC7Q9UJX3 599 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 RELL1Q8IUW5 271 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ATL2Q8NHH9 583 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D31Q96DN5 1066 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM81BQ96LP2 452 aa23.62■■□□□ 1.37
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