RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 MDM1Q8TC05 714 aa22.23■■□□□ 1.15
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STRADB-201ENST00000194530 CEP170P1Q96L14 293 aa22.23■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.23■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 FDX1P10109 184 aa22.23■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 PLCB4Q15147 1175 aa22.23■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 NSMFQ6X4W1 530 aa22.23■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 GPD1LQ8N335 351 aa22.23■■□□□ 1.15
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STRADB-201ENST00000194530 COL4A5P29400 1685 aa22.23■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 MAFGO15525 162 aa22.22■■□□□ 1.15
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STRADB-201ENST00000194530 DRD4P21917 467 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 GARTP22102 1010 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 CALCOCO2Q13137 446 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 ICE2Q659A1 982 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 GPRASP2Q96D09 838 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 AZI2Q9H6S1 392 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 RIPK2O43353 540 aa22.22■■□□□ 1.15
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STRADB-201ENST00000194530 CCND2P30279 289 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 MAPK4P31152 587 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 KCNJ1P48048 391 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 PPP1R7Q15435 360 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.21■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.21■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.21■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 CLDN3O15551 220 aa22.2■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 CHN1P15882 459 aa22.2■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 DGKZQ13574 1117 aa22.2■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.2■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.2■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.2■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 WHRNQ9P202 907 aa22.2■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.2■■□□□ 1.15
STRADB-201ENST00000194530 RTP1P59025 263 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 SGO2Q562F6 1265 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ZNF677Q86XU0 584 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 TRIM11Q96F44 468 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 SMIM23A6NLE4 172 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 VGLL3A8MV65 326 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 RASGRF2O14827 1237 aa22.19■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 FGFR4P22455 802 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 SLC1A1P43005 524 aa22.19■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 CXCL9Q07325 125 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 P3H4Q92791 437 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 H0YCG3 227 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 VWA5AO00534 786 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ZNF862O60290 1169 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 NR3C2P08235 984 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ABCD1P33897 745 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 MAN1A1P33908 653 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 SOX10P56693 466 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 BPIFB4P59827 614 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 TEPSINQ96N21 525 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.19■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 STK32BQ9NY57 414 aa22.19■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 STBD1O95210 358 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 PSAPP07602 524 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ITIH2P19823 946 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 MTMR2Q13614 643 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 TNFAIP1Q13829 316 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 IFT74Q96LB3 600 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 RNF146Q9NTX7 359 aa22.18■■□□□ 1.14
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