RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000066279.10

Sh3bp4-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp4, Length 4,995 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Bace1P56818 501 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Irx2P81066 474 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Plekhf1Q3TB82 279 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Afap1l2Q5DTU0 825 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Atp13a4Q5XF90 1193 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Celf4Q7TSY6 486 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 SgczQ8BX51 311 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mtmr6Q8VE11 617 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cyp4f16Q99N17 524 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Myo1cQ9WTI7 1063 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zfp850J3QPC5 689 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Bcat1P24288 386 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fgfr4Q03142 799 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cog7Q3UM29 770 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmtc1Q3UV71 942 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PighQ5M9N4 188 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Phactr3Q8BYK5 558 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Hdac11Q91WA3 347 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rpap3Q9D706 660 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Soat2O88908 525 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ndufs6P52503 116 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Actr2P61161 394 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 YdjcQ14BV6 310 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmed1Q3V009 227 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4933427I04RikQ3V053 235 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sp8Q8BMJ8 486 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Suds3Q8BR65 328 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tlr9Q9EQU3 1032 aa13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zfyve9A2A8R0 1397 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Slc1a1P51906 523 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 InscQ3HNM7 579 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Heatr9Q5QNV8 569 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mcf2lQ64096 1149 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tspyl5Q69ZB3 406 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zfp454Q80Y34 536 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Elmo3Q8BYZ7 720 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Xirp1O70373 1129 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Znf746Q3U133 652 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ankrd34bQ3UUF8 508 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Shc3Q61120 474 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ttc7aQ8BGB2 858 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cyp2c50Q91X77 490 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Plagl2Q925T4 496 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Thumpd2Q9CZB3 528 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tjp3Q9QXY1 905 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nlrp1bA1Z198 1177 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Casp8O89110 480 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Map4k1P70218 827 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dusp4Q8BFV3 398 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Leng8Q8CBY3 785 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trpd52l3Q9CQ14 231 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 EcsitQ9QZH6 435 aa13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Akap17bA2A3V1 959 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Arhgef26D3YYY8 869 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm5689F6Y2A6 97 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Col6a1Q04857 1025 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 HdxQ14B70 692 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nlrp4eQ66X19 978 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sec23ipQ6NZC7 998 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmem260Q8BMD6 703 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Smtnl2Q8CI12 456 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Vps39Q8R5L3 886 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trpv2Q9WTR1 756 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pck1Q9Z2V4 622 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nwd1A6H603 1563 aa13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tcp11x2A2AEI7 503 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Kcnn2P58390 839 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cops2P61202 443 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Creb3Q61817 404 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PoliQ6R3M4 717 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 TdrkhQ80VL1 560 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Appl1Q8K3H0 707 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm4307E9PZY4 289 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm4312K9J7E2 289 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trappc3O55013 180 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rab6bP61294 208 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Lrch1P62046 709 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ptgs2Q05769 604 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmem26Q3UP23 366 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Q8BWG4 1187 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Polr3cQ9D483 533 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mup5P11591 180 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NficP70255 439 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NfibP97863 570 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mrgprb8Q7TN51 330 aa13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.7 ms