RNA–Protein interactions for RNA: YJL174W

KRE9, Transcript of Glycoprotein involved in cell wall beta-glucan assembly, yeast

Gene KRE9, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE9	YJL174W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	ATP7	P30902	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	PEX22	P39718	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	VAB2	P40003	282 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YJR079W	P47126	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	ASI3	P53983	676 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YML018C	Q03730	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	CDC123	Q05791	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	HKR1	P41809	1802 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	PET8	P38921	284 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YNL194C	P40169	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YPS5	P53057	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	MCT1	Q12283	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	ICT1	Q12385	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	SWI1	P09547	1314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	CBF1	P17106	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	APA2	P22108	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	JEN1	P36035	616 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	BMT2	P38278	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	GET1	P53192	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	TPC1	P53257	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	SWS2	P53937	143 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	VAC7	P53950	1165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	PLB3	Q08108	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YCR102C	P25608	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YBR241C	P38142	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	FZO1	P38297	855 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	FRT2	P39734	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	HEM14	P40012	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	BNS1	P50084	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	NBP35	P52920	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	GIM5	Q04493	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	HTB2	P02294	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	STE7	P06784	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	ADE1	P27616	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
KRE9	YJL174W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	TAF14	P35189	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YKL075C	P36083	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	VPS51	P36116	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	ATG12	P38316	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	SPL2	P38839	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YIL067C	P40514	678 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	ATG18	P43601	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	RMR1	P53060	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	SDS23	P53172	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	CRH1	P53301	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YNR066C	P53752	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	DIA1	P54005	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	ADD37	Q03233	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	VPS60	Q03390	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	SCS7	Q03529	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YET2	Q04210	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	PPT2	Q12036	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	VIK1	Q12045	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	ERV2	Q12284	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	CSE2	P33308	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	MRP21	P38175	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	IKI1	P38874	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YER186C	P40101	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YIL001W	P40560	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	EGT2	P42835	1041 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	BIR1	P47134	954 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	MGA1	P53050	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	COG7	P53195	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	CRZ1	P53968	678 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	PBA1	Q05778	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	ATG17	Q06410	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	IRC25	Q07951	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	DCN1	Q12395	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KRE9	YJL174W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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