RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636404.1

DPAGT1-215, Transcript of dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1, human

TSL 5

Gene DPAGT1, Length 700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DPAGT1-215	ENST00000636404	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	LMF1	Q96S06	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ACOT7	O00154	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	TRAF5	O00463	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	KATNA1	O75449	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	RASGRP1	O95267	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	COL6A2	P12110	1019 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	PHKG2	P15735	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	GRK2	P25098	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	CHRNA5	P30532	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	GRK3	P35626	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	GLRB	P48167	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	FOXE3	Q13461	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	EDA	Q92838	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	CDC6	Q99741	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	PANK3	Q9H999	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	RAB27A	P51159	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	DUSP8	Q13202	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ITPK1	Q13572	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404		Q6ZSN1	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	PIGB	Q92521	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	SCN4A	P35499	1836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	AGRP	O00253	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	CAND2	O75155	1236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	FBXO21	O94952	628 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404		H0Y858	1186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	MATN2	O00339	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	AKAP10	O43572	662 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	CREB3	O43889	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	FGFR1	P11362	822 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	GNAT1	P11488	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DPAGT1-215	ENST00000636404	CPE	P16870	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms