RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 NME8Q8N427 588 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 HVCN1Q96D96 273 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 SCLT1Q96NL6 688 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 TMEM206Q9H813 350 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-208ENST00000635751 CCDC151A5D8V7 595 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TGFB1I1O43294 461 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PHKA2P46019 1235 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CDK7P50613 346 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 EFNA5P52803 228 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 KIF5AQ12840 1032 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 RRAGAQ7L523 313 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 BAP1Q92560 729 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TFR2Q9UP52 801 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 USP20Q9Y2K6 914 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 RCCD1A6NED2 376 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 LRRC53A6NM62 1247 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PDXKO00764 312 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 B4GALT4O60513 344 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 LCA5LO95447 670 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ABCD1P33897 745 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CDC42EP1Q00587 391 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 STRN3Q13033 797 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PDXDC1Q6P996 788 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ZNF410Q86VK4 478 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 KCNN1Q92952 543 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 GBP3Q9H0R5 595 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ANO9A1A5B4 782 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CLIC2O15247 247 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 SCP2P22307 547 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 KIF11P52732 1056 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CYP27A1Q02318 531 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 KCNMA1Q12791 1236 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PTK7Q13308 1070 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 DEF6Q9H4E7 631 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CEP72Q9P209 647 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TISP43B9A030 160 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ZNF263O14978 683 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 EDN1P05305 212 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 IQCF3P0C7M6 154 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 DMTNQ08495 405 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 MAPK6Q16659 721 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 RSPH3Q86UC2 560 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 OSMRQ99650 979 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 RAB21Q9UL25 225 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 SAR1BQ9Y6B6 198 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PRKCBP05771 671 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 COL6A1P12109 1028 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ADAM9Q13443 819 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 BICD1Q96G01 975 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 FZD8Q9H461 694 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CETN3O15182 167 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 THPOP40225 353 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 RPAINQ86UA6 219 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms