RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADRB1P08588 477 aa7.57□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 AKAP13Q12802 2813 aa7.56□□□□□ -1.2
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 SHC2P98077 582 aa7.55□□□□□ -1.2
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PARM1Q6UWI2 310 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.55□□□□□ -1.2
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 FERMT3Q86UX7 667 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C4orf19Q8IY42 314 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.55□□□□□ -1.2
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.55□□□□□ -1.2
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