RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	GPD1L	Q8N335	351 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	BAP1	Q92560	729 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC51	Q96ER9	411 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	NLRP4	Q96MN2	994 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	DNAJC7	Q99615	494 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	NUP58	Q9BVL2	599 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	SIX2	Q9NPC8	291 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.98	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	KBTBD13	C9JR72	458 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ACKR2	O00590	384 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	KIAA0355	O15063	1070 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	PMM2	O15305	246 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	TREH	O43280	583 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	B4GALT5	O43286	388 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	EXTL3	O43909	919 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	STX10	O60499	249 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	GPR32	O75388	356 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	RARB	P10826	455 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ACTN1	P12814	892 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	PON1	P27169	355 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	TMOD1	P28289	359 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	KCNJ6	P48051	423 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	VAMP7	P51809	220 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ZBED6	P86452	979 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ENPEP	Q07075	957 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	MAPK6	Q16659	721 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	CNGA4	Q8IV77	575 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	NEK11	Q8NG66	645 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	LMO3	Q8TAP4	145 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	TMC2	Q8TDI7	906 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF516	Q92618	1163 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	TIFA	Q96CG3	184 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	BICD1	Q96G01	975 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	AKT3	Q9Y243	479 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	GRIN2D	O15399	1336 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	SCN5A	Q14524	2016 aa		7.96	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	TET1	Q8NFU7	2136 aa		7.96	□□□□□ -1.13
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF233	A6NK53	670 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	LRRN2	O75325	713 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	TOM1L1	O75674	476 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	CLTB	P09497	229 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	CYP2C9	P11712	490 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	KRT13	P13646	458 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	PHKA2	P46019	1235 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	ACOT2	P49753	483 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	CHMP4BP1	P59074	171 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	CLDN10	P78369	228 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	MYL7	Q01449	175 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	FPGS	Q05932	587 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	MCL1	Q07820	350 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	MTF1	Q14872	753 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	PSMD6	Q15008	389 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PVT1-222	ENST00000613916	KCNA10	Q16322	511 aa		7.96	□□□□□ -1.14

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