RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 APOL6Q9BWW8 343 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 RNF39Q9H2S5 420 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 DACH1Q9UI36 760 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 TRIP11Q15643 1979 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4D-208ENST00000588667 TRANK1O15050 2925 aa22.02■■□□□ 1.12
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ATG4D-208ENST00000588667 MCF2P10911 925 aa22.02■■□□□ 1.11
ATG4D-208ENST00000588667 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.02■■□□□ 1.11
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ATG4D-208ENST00000588667 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.02■■□□□ 1.11
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ATG4D-208ENST00000588667 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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ATG4D-208ENST00000588667 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4D-208ENST00000588667 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.01■■□□□ 1.11
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ATG4D-208ENST00000588667 ACCSQ96QU6 501 aa22■■□□□ 1.11
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ATG4D-208ENST00000588667 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.97■■□□□ 1.11
ATG4D-208ENST00000588667 A0A0B4J269 797 aa21.96■■□□□ 1.11
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ATG4D-208ENST00000588667 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.96■■□□□ 1.11
ATG4D-208ENST00000588667 POMCP01189 267 aa21.96■■□□□ 1.11
ATG4D-208ENST00000588667 SCNN1GP51170 649 aa21.96■■□□□ 1.11
ATG4D-208ENST00000588667 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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ATG4D-208ENST00000588667 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.96■■□□□ 1.11
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